DNA转座子在哺乳动物和其他四脚动物中重复的水平转移
作者:John K. Pace II, Clément Gilbert, Marlena S. Clark,Cédric Feschotte
摘要
水平转移在原核生物进化中至关重要。自私的、可移动的遗传成分,例如噬菌体、质粒和转座子,是原核生物中水平转移的首要媒介。在多细胞的真核细胞中水平转移的流行程度和进化学意义仍不清楚。本文我们确认了一系列DNA转座子超家族命名为太空入侵者 (或 SPIN) ,在啮齿目鼠科(大鼠或小鼠),婴猴(原猴亚目灵长类),小棕蝙蝠,马岛猬,负鼠,和两个非哺乳类的四脚动物(变色蜥蜴和非洲有爪青蛙)基因组中,他们的序列在他们全长范围(2.9kb)内96%相似。
对比发现,SPIN元素在序列库中描绘的其他物种中未监测到,包括19种其他带有全基因组图谱的哺乳动物。这种不协调的分布,以及在分支很大的四脚动物中SPIN 高度一致以及全部缺少作用于这些成分的选择性限制,是与垂直遗传相反的,但是很好的显示了水平传导的多样性。
我们发现这些种系渗透很可能发生在大约1500万年到4600万年的类似时间段中,造成一些曾经记录在所有种系中的DNA转座子活性的大爆发(每个马岛猬单倍体基因组中大约10万个SPIN 拷贝)。这过程同样导致了在鼠科的世系中源于SPIN转位酶的新基因出现。简要地说,DNA转座子的水平转移对于修整和多样化多倍体哺乳动物和四脚动物种类具有十分重要的贡献。
译自《Repeated horizontal transfer of a DNA transposon in mammals and other tetrapods.》Pace JK, Gilbert C, Clark MS, Feschotte C,Proc Natl Acad Sci U S A 2008 Nov 4 105 (44):17023-8
链接:http://www.pnas.org/content/105/44/17023